RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	ALR2	P43553	858 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	NET1	P47035	1189 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	LCD1	Q04377	747 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	FMP25	Q08023	583 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CKA2	P19454	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RDS1	P25611	832 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CHS3	P29465	1165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TOK1	P40310	691 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	PCI8	P40512	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YPT11	P48559	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MYO1	P08964	1928 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	FOB1	O13329	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RPD3	P32561	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YBR284W	P38150	797 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CSM2	P40465	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	EPL1	P43572	832 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	BUL1	P48524	976 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	GUD1	Q07729	489 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	DCS2	Q12123	353 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TIM23	P32897	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	ACA1	P39970	489 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	DJP1	P40564	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	VTC2	P43585	828 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	HDA1	P53973	706 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SEC5	P89102	971 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MFM1	Q02783	413 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MMR1	Q06324	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	UBX5	Q06682	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	CDC11	P32458	415 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	REC104	P33323	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YIL089W	P40500	205 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	THI6	P41835	540 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	LIF1	P53150	421 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	EAF1	Q06337	982 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SPO75	Q07798	868 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	FBP1	P09201	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SPC110	P32380	944 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	HIR1	P32479	840 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	MCD4	P36051	919 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RKM3	P38222	552 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	SDP1	P40479	209 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	HUL5	P53119	910 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	ERP6	P53198	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	YML037C	Q03703	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	RBA50	Q04418	439 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	PHM6	Q05637	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	FUS2	Q05670	677 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CPR4	YCR069W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RAD18	P10862	487 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MBR1	P23493	339 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MRPL10	P36520	322 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YER130C	P39959	443 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	NUP82	P40368	713 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	CEP3	P40969	608 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YGR153W	P48238	217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	FMS1	P50264	508 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YGL081W	P53156	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SPH1	Q06160	661 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ARE1	P25628	610 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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