RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623882.3

CERS1-204, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-204ENST00000623882 SMIM5Q71RC9 77 aa28.12■■■□□ 2.09
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CERS1-204ENST00000623882 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-204ENST00000623882 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CERS1-204ENST00000623882 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CERS1-204ENST00000623882 B4E1Z4 1266 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-204ENST00000623882 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
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CERS1-204ENST00000623882 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.09■■■□□ 2.09
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CERS1-204ENST00000623882 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.09■■■□□ 2.09
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CERS1-204ENST00000623882 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.08■■■□□ 2.09
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CERS1-204ENST00000623882 A0A087WWV3 80 aa28.08■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.08■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 KLHL34Q8N239 644 aa28.07■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 MAP3K12Q12852 859 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.06■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 LRP5O75197 1615 aa28.06■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 PCDHA7Q9UN72 937 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 CDC27P30260 824 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 PHKBQ93100 1093 aa28.04■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 NAPBQ9H115 298 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 LCORLQ8N3X6 602 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 ZNF165P49910 485 aa28.02■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CERS1-204ENST00000623882 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.02■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 APOA5Q6Q788 366 aa28.02■■■□□ 2.08
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CERS1-204ENST00000623882 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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CERS1-204ENST00000623882 ATL3Q6DD88 541 aa28■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 ZMYM6O95789 1325 aa28■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 GYG1P46976 350 aa27.99■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.99■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CERS1-204ENST00000623882 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
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