RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567312.5

TRAPPC2L-212, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 499 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
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TRAPPC2L-212ENST00000567312 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.96■□□□□ 0.15
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TRAPPC2L-212ENST00000567312 PSMC4P43686 418 aa15.88■□□□□ 0.13
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TRAPPC2L-212ENST00000567312 PRO3102Q9H379 93 aa15.88■□□□□ 0.13
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TRAPPC2L-212ENST00000567312 RNF208Q9H0X6 261 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 F6X3S4 739 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 HOXD10P28358 340 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 UBE4AQ14139 1066 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 TEKT1Q969V4 418 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PDHXO00330 501 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 INPP5BP32019 993 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 PRKCZQ05513 592 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2L-212ENST00000567312 DCAF15Q66K64 600 aa15.84■□□□□ 0.13
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