RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 LAMB1P07942 1786 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 TNNI2P48788 182 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 TEPSINQ96N21 525 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 SP3Q02447 781 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 GRIK5Q16478 980 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 LRRC24Q50LG9 513 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 METTL24Q5JXM2 366 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 EFCC1Q9HA90 598 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-214ENST00000548849 UTYO14607 1347 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 MAP3K9P80192 1104 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 OTOFQ9HC10 1997 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 POTEFA5A3E0 1075 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CSADQ9Y600 493 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 GTF2A2P52657 109 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 VGLL4Q14135 290 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CCL15Q16663 113 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 TEKT1Q969V4 418 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 PDE8BO95263 885 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 BCAMP50895 628 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CACNB3P54284 484 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 OTUD5Q96G74 571 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.36■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 CAP1Q01518 475 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ARHGEF6Q15052 776 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 ARMC5Q96C12 935 aa21.33■■□□□ 1.01
CS-214ENST00000548849 PTPRCP08575 1304 aa21.32■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.32■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 MRIQ9BWK5 157 aa21.32■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 HTTP42858 3142 aa21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 HOOK2Q96ED9 719 aa21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 WRNIP1Q96S55 665 aa21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.31■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 MAST3O60307 1309 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ZNF521Q96K83 1311 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 FAM83AQ86UY5 434 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ERO1BQ86YB8 467 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 GCC1Q96CN9 775 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 USP44Q9H0E7 712 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 CENPFP49454 3210 aa21.3■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 CETPP11597 493 aa21.29■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 FGFR2P21802 821 aa21.29■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 NBPF11Q86T75 865 aa21.29■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 DCAF15Q66K64 600 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 KIF16BQ96L93 1317 aa21.28■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 EYA2O00167 538 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 IRF6O14896 467 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SLC5A1P13866 664 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 SNAPC2Q13487 334 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 ZNF333Q96JL9 665 aa21.27■■□□□ 1
CS-214ENST00000548849 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 BTBD19C9JJ37 291 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 E9PSI1 815 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 TLR2O60603 784 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 KIF22Q14807 665 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 LPIN2Q92539 896 aa21.26■□□□□ 0.99
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