RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.92■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.92■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.92■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 ALDH1L1O75891 902 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TNFAIP1Q13829 316 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 GRIK5Q16478 980 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 SUCLG2Q96I99 432 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-208ENST00000531857 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CRKP46108 304 aa21.89■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 SP3Q02447 781 aa21.89■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 EFCC1Q9HA90 598 aa21.89■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.88■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.88■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 VGLL4Q14135 290 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 ARMC5Q96C12 935 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 BRCA2P51587 3418 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CACNB3P54284 484 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 MAP3K9P80192 1104 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 LRRC24Q50LG9 513 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CCL15Q16663 113 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 OTUD5Q96G74 571 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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PKP3-208ENST00000531857 TNNI2P48788 182 aa21.84■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.84■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 GTF2A2P52657 109 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 VPS37DQ86XT2 251 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 CSADQ9Y600 493 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP3-208ENST00000531857 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 GCC1Q96CN9 775 aa21.82■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.82■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 AK9Q5TCS8 1911 aa21.81■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.81■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.81■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.8■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ANP32CO43423 234 aa21.8■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 TEKT1Q969V4 418 aa21.8■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ZNF333Q96JL9 665 aa21.8■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.79■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.78■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 WRNIP1Q96S55 665 aa21.78■■□□□ 1.08
PKP3-208ENST00000531857 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.78■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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PKP3-208ENST00000531857 IRF6O14896 467 aa21.76■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 TLR2O60603 784 aa21.76■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 CETPP11597 493 aa21.76■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 ARHGEF6Q15052 776 aa21.76■■□□□ 1.07
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PKP3-208ENST00000531857 ZNF521Q96K83 1311 aa21.75■■□□□ 1.07
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PKP3-208ENST00000531857 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 PPIL2Q13356 520 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 SNAPC2Q13487 334 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP3-208ENST00000531857 MAST3O60307 1309 aa21.73■■□□□ 1.07
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