RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 GNAI2P04899 355 aa30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADORA1P30542 326 aa30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 NF2P35240 595 aa30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.67■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.66■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.65■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHKA1P46020 1223 aa30.65■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.65■■■□□ 2.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 TIMM10P62072 90 aa30.63■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 TFCP2Q12800 502 aa30.63■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 RASA3Q14644 834 aa30.62■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.62■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDAN1Q8IWY9 1227 aa30.61■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CSRNP1Q96S65 589 aa30.61■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.61■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARMC9Q7Z3E5 817 aa30.6■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.6■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 TEKT1Q969V4 418 aa30.6■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 OTOFQ9HC10 1997 aa30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CACNB3P54284 484 aa30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 WDR66Q8TBY9 1149 aa30.59■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 A0A1B0GUL7 405 aa30.58■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CA12O43570 354 aa30.58■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAPN15O75808 1086 aa30.58■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.58■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC102BQ68D86 513 aa30.58■■■□□ 2.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRDX5P30044 214 aa30.57■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 PANK1Q8TE04 598 aa30.57■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.57■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa30.57■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 XAGE2Q96GT9 111 aa30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 TEPSINQ96N21 525 aa30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM39BQ9GZU3 492 aa30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNF186Q9NXI6 227 aa30.56■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 POLA2Q14181 598 aa30.55■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 CLMNQ96JQ2 1002 aa30.55■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYH2Q9UKX2 1941 aa30.55■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAST3O60307 1309 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPA1O75762 1119 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNFAIP1Q13829 316 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 RASGRF1Q13972 1273 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 DIXDC1Q155Q3 683 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K11Q16584 847 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRIQ9BWK5 157 aa30.54■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP8B2P98198 1209 aa30.53■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 DENND2AQ9ULE3 1009 aa30.53■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.53■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP2O75604 605 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.52■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.52■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa30.52■■■□□ 2.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEMA3EO15041 775 aa30.51■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SSH3Q8TE77 659 aa30.51■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SALL1Q9NSC2 1324 aa30.5■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 LDHBP07195 334 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.5■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 LAMB1P07942 1786 aa30.49■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPRYD7Q5W111 196 aa30.49■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNNI2P48788 182 aa30.48■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC10A4Q96EP9 437 aa30.48■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 PI16Q6UXB8 463 aa30.47■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 AK9Q5TCS8 1911 aa30.47■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBTB22O15209 634 aa30.46■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 IREB2P48200 963 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMOD2Q9NZR1 351 aa30.46■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 GJA5P36382 358 aa30.45■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.45■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 WNK4Q96J92 1243 aa30.45■■■□□ 2.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 TM4SF4P48230 202 aa30.44■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP85Q6P2H3 762 aa30.44■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCF2Q9UG63 623 aa30.44■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.43■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.43■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 NFIAQ12857 509 aa30.42■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 GORABQ5T7V8 394 aa30.42■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.42■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM83AQ86UY5 434 aa30.42■■■□□ 2.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa30.42■■■□□ 2.46
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