RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RHOV	Q96L33	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OIP5	O43482	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BMP6	P22004	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARNT	P27540	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GMPR	P36959	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GJA8	P48165	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LMNB2	Q03252	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GART	P22102	1010 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARL4D	P49703	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SEPT6	Q14141	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC14	Q15048	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBXN4	Q92575	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FSCN2	O14926	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GREM1	O60565	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	F13A1	P00488	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCNB2	Q92953	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GML	Q99445	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WFS1	O76024	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ECEL1	O95672	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CRK	P46108	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP11A1	P05108	521 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FGR	P09769	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAOB	P27338	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NLRP12	P59046	1061 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POU4F3	Q15319	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WNT8B	Q93098	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NKD1	Q969G9	470 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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