RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM29Q14134 588 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ZSCAN26Q16670 478 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM259Q4ZIN3 620 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 NLRP13Q86W25 1043 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC89Q8N998 374 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 ADGRB1O14514 1584 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SHTN1A0MZ66 631 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 DYNC1I1O14576 645 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L8P0C7I0 530 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TGFB3P10600 412 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 VCAM1P19320 739 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 GUCY2CP25092 1073 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 STIP1P31948 543 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE4AQ14139 1066 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 GBP4Q96PP9 640 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 MAFFQ9ULX9 164 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM94Q12767 1356 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PIK3R4Q99570 1358 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PLIN1O60240 522 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 GIMAP1Q8WWP7 306 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPV5Q9NQA5 729 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.27□□□□□ -0.76
RABGGTB-214ENST00000497648 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 E2F6O75461 281 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM32Q13049 653 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 NAT2P11245 290 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CTHP32929 405 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNJ4P48050 445 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAF1Q13077 416 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 VEZTQ9HBM0 779 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CHL1O00533 1208 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CAPN2P17655 700 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CASP2P42575 452 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 DAAM2Q86T65 1068 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 COMMD8Q9NX08 183 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 PTCH1Q13635 1447 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA0754O94854 1291 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 PIK3CAP42336 1068 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 SKOR1P84550 965 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS72Q15906 364 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC30AQ86WT1 665 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-214ENST00000497648 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms