RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-231	ENST00000477334	TM4SF5	O14894	197 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	GSTT1	P30711	240 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CABP4	P57796	275 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	LRP8	Q14114	963 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.21	□□□□□ -1.26	4e-21	■□□□□ 8
RBM39-231	ENST00000477334	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	FSCN2	O14926	492 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	WISP1	O95388	367 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	GLB1	P16278	677 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ITPKA	P23677	461 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334		H3BRJ5	948 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CTSH	P09668	335 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	IKBKE	Q14164	716 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO24	O75426	580 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	FST	P19883	344 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ITGAE	P38570	1179 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	WNT8B	Q93098	351 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ADAM11	O75078	769 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	PIP4K2B	P78356	416 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	NBPF11	Q86T75	865 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RBM39-231	ENST00000477334	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	RECK	O95980	971 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	B3GALT4	O96024	378 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	ARL4D	P49703	201 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	GSTM4	Q03013	218 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	GSC2	O15499	205 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	VAMP1	P23763	118 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334		E9PSI1	815 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	CELA3A	P09093	270 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	NLRP12	P59046	1061 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM39-231	ENST00000477334	ENC1	O14682	589 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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