RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KCNB2Q92953 911 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KIF2CQ99661 725 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MMP10P09238 476 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SRGNP10124 158 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ADORA1P30542 326 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PDE6BP35913 854 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MCAMP43121 646 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC102BQ68D86 513 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RILPL2Q969X0 211 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KCNK17Q96T54 332 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IL25Q9H293 177 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CACNA1SQ13698 1873 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LAMA4Q16363 1823 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 XDHP47989 1333 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NPR1P16066 1061 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PHKA1P46020 1223 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SCARF1Q14162 830 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HIC1Q14526 733 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 STYK1Q6J9G0 422 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 POTEGQ6S5H5 508 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SNX21Q969T3 373 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A0D9SFI3 127 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HSPA4P34932 840 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RASGRF1Q13972 1273 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 UBE3CQ15386 1083 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SP8Q8IXZ3 490 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MAP4K1Q92918 833 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FSD1Q9BTV5 496 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PSME4Q14997 1843 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZMYM6O95789 1325 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GOLIM4O00461 696 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ARHGAP33O14559 1287 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TAF5LO75529 589 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP2B4P23634 1241 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ALDH1B1P30837 517 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PBX2P40425 430 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZAP70P43403 619 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PTGDRQ13258 359 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NECTIN1Q15223 517 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GORABQ5T7V8 394 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPATA5Q8NB90 893 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 APPBP2Q92624 585 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MASTLQ96GX5 879 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM227BQ96M60 508 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SLX4Q8IY92 1834 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MAST3O60307 1309 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NPHP1O15259 732 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZMYND10O75800 440 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms