RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CA12O43570 354 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RASA3Q14644 834 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GNAI2P04899 355 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADORA1P30542 326 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNF186Q9NXI6 227 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHKA1P46020 1223 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TIMM10P62072 90 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRPA1O75762 1119 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RLBP1P12271 317 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TFCP2Q12800 502 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAP3K11Q16584 847 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MRIQ9BWK5 157 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TEKT1Q969V4 418 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TEPSINQ96N21 525 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CACNB3P54284 484 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC102BQ68D86 513 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNFAIP1Q13829 316 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A1B0GUL7 405 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRDX5P30044 214 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPRYD7Q5W111 196 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XAGE2Q96GT9 111 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TM4SF4P48230 202 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAST3O60307 1309 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SEMA3EO15041 775 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBTB22O15209 634 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP8B2P98198 1209 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POLA2Q14181 598 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNNI2P48788 182 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RASGRF1Q13972 1273 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABHD8Q96I13 439 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PANK1Q8TE04 598 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SSH3Q8TE77 659 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WNK4Q96J92 1243 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OTOFQ9HC10 1997 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UNCXA6NJT0 531 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBC1D8O95759 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GJA5P36382 358 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM83AQ86UY5 434 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SREBF2Q12772 1141 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DGKZQ13574 1117 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ELP3Q9H9T3 547 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAP3K9P80192 1104 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NFIAQ12857 509 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms