RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LTB-210ENST00000429299 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LTB-210ENST00000429299 CSADQ9Y600 493 aa24.64■■□□□ 1.54
LTB-210ENST00000429299 CCER2I3L3R5 266 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 PLIN1O60240 522 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 TNNI2P48788 182 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 VGLL4Q14135 290 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 KIF22Q14807 665 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 TLR2O60603 784 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 GNRH1P01148 92 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 WWC1Q8IX03 1113 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 OTUD5Q96G74 571 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.61■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 H0YGN5 161 aa24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CETPP11597 493 aa24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 UBE4AQ14139 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.6■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 PRMT2P55345 433 aa24.59■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 IL16Q14005 1332 aa24.59■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 OTOFQ9HC10 1997 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 SZT2Q5T011 3432 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CRKP46108 304 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 BEND3Q5T5X7 828 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 ERO1BQ86YB8 467 aa24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
LTB-210ENST00000429299 CACNA1FO60840 1977 aa24.58■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 GYG1P46976 350 aa24.57■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.57■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.57■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 A0A1B0GUL6 1792 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 VAMP4O75379 141 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 SNAPC2Q13487 334 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 HOOK2Q96ED9 719 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.55■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 BTBD19C9JJ37 291 aa24.54■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 GRM8O00222 908 aa24.54■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.54■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 F6X3S4 739 aa24.53■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 MIER1Q8N108 512 aa24.53■■□□□ 1.52
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LTB-210ENST00000429299 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LTB-210ENST00000429299 PPIL2Q13356 520 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 C17orf99Q6UX52 265 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 VPS37DQ86XT2 251 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 DPF3Q92784 378 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 TEKT1Q969V4 418 aa24.51■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 HOXD10P28358 340 aa24.5■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 CACNB3P54284 484 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 PPATQ06203 517 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 GRIK5Q16478 980 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 SRRDQ9UH36 339 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.49■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 DCAF15Q66K64 600 aa24.48■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 ALDH1L1O75891 902 aa24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 PSMC4P43686 418 aa24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 MTFR1Q15390 333 aa24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 SHISA4Q96DD7 197 aa24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 RAET1EQ8TD07 263 aa24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 TRIM47Q96LD4 638 aa24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LTB-210ENST00000429299 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.46■■□□□ 1.51
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