RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 TRAF5O00463 557 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 IRF6O14896 467 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRNQ16849 979 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 JDP2Q8WYK2 163 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A1P11836 297 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 AOC3Q16853 763 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CST9Q5W186 159 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF511Q8NB15 262 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 BAP1Q92560 729 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 LAMB2P55268 1798 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ADH1CP00326 375 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 AIDAQ96BJ3 306 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC4O15439 1325 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PPIP5K2O43314 1243 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CXCL9Q07325 125 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 SCARF1Q14162 830 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 KRT24Q2M2I5 525 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01559Q495D7 138 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 NIM1KQ8IY84 436 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF428Q96B54 188 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 COL4A1P02462 1669 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TAF1P21675 1872 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 SHTN1A0MZ66 631 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PPFIA3O75145 1194 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 KRT76Q01546 638 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PARP10Q53GL7 1025 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 NLRP10Q86W26 655 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CAPNS2Q96L46 248 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 NLRP3Q96P20 1036 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 NEFMP07197 916 aa8.61□□□□□ -1.03
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HOXD8-202ENST00000429017 RIPK4P57078 832 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 KCNH2Q12809 1159 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 COPS6Q7L5N1 327 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 YDJCA8MPS7 323 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 AOC2O75106 756 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 GRM1Q13255 1194 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 DLK2Q6UY11 383 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 SP8Q8IXZ3 490 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD8Q96I13 439 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 CDK15Q96Q40 435 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 RAD17O75943 681 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 FDX1P10109 184 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 TCIRG1Q13488 830 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 VPS33BQ9H267 617 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXD8-202ENST00000429017 BBOX1O75936 387 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 GRAPQ13588 217 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 CHL1O00533 1208 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.58□□□□□ -1.04
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