RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 PCDH1Q08174 1060 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 TCF12Q99081 682 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 RNF114Q9Y508 228 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PP55 124 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ABL1P00519 1130 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ADH5P11766 374 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ZAR1Q86SH2 424 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CYP11A1P05108 521 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 GRIA4P48058 902 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 GATA6Q92908 595 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRK-202ENST00000368205 ADMP35318 185 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ABI1Q8IZP0 508 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 SHISA5Q8N114 240 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ICMTO60725 284 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CTSBP07858 339 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 MAOBP27338 520 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 POU4F3Q15319 338 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 FBXL18Q96ME1 805 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CARNS1A5YM72 827 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CYP26A1O43174 497 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 NEFLP07196 543 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 MAP7Q14244 749 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 USTQ9Y2C2 406 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 B3GALT4O96024 378 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ITPKAP23677 461 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ECM1Q16610 540 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CBLL1Q75N03 491 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CYP27A1Q02318 531 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF576Q9H609 170 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 FAM170BA6NMN3 283 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 NFICP08651 508 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 CORO1BQ9BR76 489 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 PDE3BQ13370 1112 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 DYMQ7RTS9 669 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 FAM129BQ96TA1 746 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-202ENST00000368205 H3BRB1 525 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFB5O43674 189 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 RAB6AP20340 208 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP4P98171 946 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 RAD18Q9NS91 495 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ECEL1O95672 775 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 AP3B2Q13367 1082 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 CITED4Q96RK1 184 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 EHD4Q9H223 541 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 NPHS2Q9NP85 383 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 AOC2O75106 756 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ASPAP45381 313 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINB4P48594 390 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 WDR18Q9BV38 432 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms