RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.91■■□□□ 1.1
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SPNS1-204ENST00000352260 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GUL6 1792 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 GPAA1O43292 621 aa21.9■■□□□ 1.1
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SPNS1-204ENST00000352260 UBE3CQ15386 1083 aa21.9■■□□□ 1.1
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SPNS1-204ENST00000352260 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TAF1P21675 1872 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 NECAB1Q8N987 351 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 FEZ1Q99689 392 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.89■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 SYCP1Q15431 976 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.88■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 LAMA4Q16363 1823 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 ADRA2BP18089 450 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZUG5 572 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 DOCK2Q92608 1830 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 ADCY5O95622 1261 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 GJB2P29033 226 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 FGAP02671 866 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 UBE4AQ14139 1066 aa21.86■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 USP25Q9UHP3 1055 aa21.85■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SPNS1-204ENST00000352260 DTNBO60941 627 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-204ENST00000352260 TM4SF1P30408 202 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 GYG1P46976 350 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 HAND2P61296 217 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 CBX1P83916 185 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 USP48Q86UV5 1035 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 NPHP1O15259 732 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2HP62256 183 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 STK3Q13188 491 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 BRF1Q92994 677 aa21.82■■□□□ 1.08
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SPNS1-204ENST00000352260 GTF3C6Q969F1 213 aa21.8■■□□□ 1.08
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SPNS1-204ENST00000352260 CNBD1Q8NA66 436 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 AIDAQ96BJ3 306 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 MTMR6Q9Y217 621 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF213O14771 459 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS1-204ENST00000352260 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SPNS1-204ENST00000352260 OGFRQ9NZT2 677 aa21.78■■□□□ 1.08
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