RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 SPAG1Q07617 926 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 SLC39A14Q15043 492 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 IQCEQ6IPM2 695 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 VSTM4Q8IW00 320 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 PDILTQ8N807 584 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 MRC1P22897 1456 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 A0A1B0GVL5 298 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 NPHP1O15259 732 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TFCP2Q12800 502 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 WASHC4Q2M389 1173 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 CCDC93Q567U6 631 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 LGR6Q9HBX8 967 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 ZNF213O14771 459 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TADA3O75528 432 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TRIM14Q14142 442 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 TMEM87BQ96K49 555 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 USP54Q70EL1 1684 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-202ENST00000320122 A0A087WZG4 1122 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 GOLIM4O00461 696 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 CIAO1O76071 339 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
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LMO3-202ENST00000320122 CARD6Q9BX69 1037 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 EFCC1Q9HA90 598 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 A6NNZ2 444 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 PRC1O43663 620 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ANXA1P04083 346 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 PFKFB1P16118 471 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 NDUFA8P51970 172 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 NBPF4Q96M43 638 aa7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-202ENST00000320122 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 CLGNO14967 610 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 TXLNAP40222 546 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 USP8P40818 1118 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 COPS6Q7L5N1 327 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 CNGA4Q8IV77 575 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 FBXW7Q969H0 707 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 USP27XA6NNY8 438 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 IGSF3O75054 1194 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-202ENST00000320122 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ZNF790Q6PG37 636 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ALG1Q9BT22 464 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 ERICH2A1L162 156 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 SEMA3EO15041 775 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-202ENST00000320122 LTKP29376 864 aa7.38□□□□□ -1.23
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