RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAB2O43741 272 aa26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 AKT1S1Q96B36 256 aa26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR6Q9Y217 621 aa26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.91■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3EO15041 775 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 F13A1P00488 732 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 ALX1Q15699 326 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 PRC1O43663 620 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 JAK2O60674 1132 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 PFKFB2O60825 505 aa26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 MCM5P33992 734 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 ANTXR2P58335 489 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 NAPBQ9H115 298 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM4-201ENST00000298454 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL16Q8N461 479 aa26.88■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYM6O95789 1325 aa26.88■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 GNAT2P19087 354 aa26.87■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF384Q8TF68 577 aa26.87■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 TRDNQ13061 729 aa26.86■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.86■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.86■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 INCENPQ9NQS7 918 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 JAG2Q9Y219 1238 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 CACNA1SQ13698 1873 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 GPT2Q8TD30 523 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 PDCP20941 246 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 EVCP57679 992 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 GPSM2P81274 684 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 CTDNEP1O95476 244 aa26.84■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.84■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 DDX11Q96FC9 970 aa26.84■■□□□ 1.89
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VSTM4-201ENST00000298454 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.83■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.83■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.83■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
VSTM4-201ENST00000298454 B4E1Z4 1266 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 PRDX5P30044 214 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 MECOMQ03112 1051 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.82■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 USP48Q86UV5 1035 aa26.81■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.81■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.8■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 BBOX1O75936 387 aa26.8■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 POTEAQ6S8J7 498 aa26.8■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 FERMT3Q86UX7 667 aa26.8■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.79■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.79■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 PPFIA3O75145 1194 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 UFL1O94874 794 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.78■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB22O15209 634 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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