RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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PKDCC-201ENST00000294964 MNS1Q8NEH6 495 aa28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF609O15014 1411 aa28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 CTAGE5O15320 804 aa28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 FOSBP53539 338 aa28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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PKDCC-201ENST00000294964 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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PKDCC-201ENST00000294964 DDX11Q96FC9 970 aa28.51■■■□□ 2.16
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC34Q96HJ3 373 aa28.51■■■□□ 2.16
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PKDCC-201ENST00000294964 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.51■■■□□ 2.15
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PKDCC-201ENST00000294964 EPC1Q9H2F5 836 aa28.51■■■□□ 2.15
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PKDCC-201ENST00000294964 ANO10Q9NW15 660 aa28.51■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GOLIM4O00461 696 aa28.5■■■□□ 2.15
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PKDCC-201ENST00000294964 LRRC24Q50LG9 513 aa28.5■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.5■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 FBXW7Q969H0 707 aa28.5■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa28.5■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 TUBB4AP04350 444 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CYP21A2P08686 494 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 TMC6Q7Z403 805 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CARD6Q9BX69 1037 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CEP57L1Q8IYX8 460 aa28.49■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 KCNJ6P48051 423 aa28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZUG5 572 aa28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GLI3P10071 1580 aa28.48■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 EFCAB8A8MWE9 144 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 FANCGO15287 622 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 BARGINQ6ZT62 677 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 NEK1Q96PY6 1258 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CHMP4CQ96CF2 233 aa28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
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PKDCC-201ENST00000294964 TNS2Q63HR2 1409 aa28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 EVCP57679 992 aa28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 AK7Q96M32 723 aa28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 HAUS7Q99871 368 aa28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP45Q9UL16 551 aa28.46■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 ICE2Q659A1 982 aa28.45■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 CTR9Q6PD62 1173 aa28.45■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.45■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
PKDCC-201ENST00000294964 ATRNO75882 1429 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 SMC2O95347 1197 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 LMAN1P49257 510 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD1Q15327 319 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.45■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 TPM1P09493 284 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 CHST3Q7LGC8 479 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 IFNKQ9P0W0 207 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 ADAM21Q9UKJ8 722 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 MRC1P22897 1456 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 H7C1W4 665 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 EXOC4Q96A65 974 aa28.44■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.143e-6■■□□□ 14.1
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PKDCC-201ENST00000294964 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 KINO60870 393 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.43■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 PSD3Q9NYI0 1048 aa28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.42■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 H3BQV1 296 aa28.41■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 EXOC5O00471 708 aa28.41■■■□□ 2.14
PKDCC-201ENST00000294964 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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