RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 INSRP06213 1382 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 EBAG9O00559 213 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC9P31274 260 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A2O14975 620 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 IP6K1Q92551 441 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND15Q9H091 742 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 OGFRQ9NZT2 677 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 CPA1P15085 419 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2C2O75185 946 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF445P59923 1031 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TNNC1P63316 161 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 EYA2O00167 538 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SGSM2O43147 1006 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 FAM13AO94988 1023 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF11Q86T75 865 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.85■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 PICALMQ13492 652 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM14Q14142 442 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 G2E3Q7L622 706 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 GCP02774 474 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 FERP16591 822 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 PLCD1P51178 756 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB2AQ13885 445 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ANO1Q5XXA6 986 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.84■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 DEXIO95424 95 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 RXRAP19793 462 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TNNI3KQ59H18 835 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.83■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ASXL2Q76L83 1435 aa23.83■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 HDXQ7Z353 690 aa23.83■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 VPS18Q9P253 973 aa23.83■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CHL1O00533 1208 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MBD4O95243 580 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 OGFOD1Q8N543 542 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 DDB1Q16531 1140 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 F8W031 263 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUL7 405 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 IL13P35225 146 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 EVCP57679 992 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 SV2BQ7L1I2 683 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 RGS22Q8NE09 1264 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 APPBP2Q92624 585 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MSL1Q68DK7 614 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC45Q96CN5 670 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC6Q16204 474 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP58Q5T655 872 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 CUTAO60888 179 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TCHPQ9BT92 498 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM10P62072 90 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 TTC6Q86TZ1 520 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 MLKLQ8NB16 471 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 IFT81Q8WYA0 676 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-201ENST00000284617 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms