RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 HLA-DOAP06340 250 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PLS1Q14651 629 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PTPN21Q16825 1174 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ATP10AO60312 1499 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TOM1O60784 492 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ADORA1P30542 326 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 PLA2R1Q13018 1463 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CUL5Q93034 780 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SPAG5Q96R06 1193 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 E7EWF7 191 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 BRD1O95696 1058 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CALM1P0DP23 149 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CALM2P0DP24 149 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CALM3P0DP25 149 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SCLT1Q96NL6 688 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CBX8Q9HC52 389 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GOPCQ9HD26 462 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 BCAMP50895 628 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TCP10Q12799 353 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 LRMPQ12912 555 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 LONRF3Q496Y0 759 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TTC6Q86TZ1 520 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SLF2Q8IX21 1173 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 USP28Q96RU2 1077 aa6.28□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 TERF1P54274 439 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ST5P78524 1137 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TCIRG1Q13488 830 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ZNF827Q17R98 1081 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ANO1Q5XXA6 986 aa6.28□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TRPM2O94759 1503 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 USP17L12C9JPN9 530 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 USP17L21D6R901 530 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 NEMFO60524 1076 aa6.28□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 HOXB7P09629 217 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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LMO3-201ENST00000261169 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 TEX11Q8IYF3 940 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 GPT2Q8TD30 523 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-201ENST00000261169 PSMA7O14818 248 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 UFL1O94874 794 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 ZNF202O95125 648 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 ATP5JP18859 108 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 KANK3Q6NY19 840 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-201ENST00000261169 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.27□□□□□ -1.41
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