RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf99Q6UX52 265 aa21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.26■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 BMP8BP34820 402 aa21.26■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 RAET1EQ8TD07 263 aa21.26■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 GDF15Q99988 308 aa21.26■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 CETPP11597 493 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 PSMC4P43686 418 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K9P80192 1104 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 TNFAIP1Q13829 316 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 MYPNQ86TC9 1320 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.25■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 CSADQ9Y600 493 aa21.24■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.23■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 SGPL1O95470 568 aa21.23■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.23■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.23■□□□□ 0.99
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SPCS1-201ENST00000233025 HOXD10P28358 340 aa21.22■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 UBXN2AP68543 259 aa21.22■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 CPA4Q9UI42 421 aa21.22■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 MUC3AQ02505 3323 aa21.21■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 IL1R1P14778 569 aa21.21■□□□□ 0.99
SPCS1-201ENST00000233025 IRF6O14896 467 aa21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 SNAPC2Q13487 334 aa21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ERO1BQ86YB8 467 aa21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.2■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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SPCS1-201ENST00000233025 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ4P48050 445 aa21.19■□□□□ 0.98
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SPCS1-201ENST00000233025 NEUROD2Q15784 382 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 TDHQ8IZJ6 230 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 GABRQQ9UN88 632 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.15■□□□□ 0.98
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.14■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.14■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 MBIPQ9NS73 344 aa21.14■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 RPTORQ8N122 1335 aa21.13■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 BCRP11274 1271 aa21.13■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 DSG3P32926 999 aa21.13■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.13■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB118Q96PH6 123 aa21.13■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.13■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TAF5LO75529 589 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 INHAP05111 366 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TNNI2P48788 182 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 FCGRTP55899 365 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY3O60266 1144 aa21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 MOGSQ13724 837 aa21.11■□□□□ 0.97
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