RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF429Q86V71 674 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5T1Q8NG75 326 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51E2Q9H255 320 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAP30O75446 220 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM177Q53S58 311 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RHOVQ96L33 236 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCGNO76038 276 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYGBP07316 175 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDC2P34741 201 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PITPNAQ00169 270 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MXD1Q05195 221 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFXN4Q6P4A7 337 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCSTAMPQ9H295 470 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM235A6NFC5 223 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTXN2P0C2S0 81 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUTP33316 252 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNG2P59768 71 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VMA21Q3ZAQ7 101 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POC5Q8NA72 575 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS14Q8TCE9 139 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SORL1Q92673 2214 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYZL1O95825 349 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM68Q96MH6 324 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2W1Q9Y3N9 320 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00473A8K010 186 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H3BUA1 57 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC2LP0C7M8 214 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX45Q8NA69 505 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDB2Q92466 427 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHB2Q99623 299 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF167Q9H6Y7 350 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JLM5 398 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2KP61086 200 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEDD8Q15843 81 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IDNKQ5T6J7 187 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACSM6Q6P461 480 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNIH2Q6PI25 160 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF645Q8N7E2 425 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4C12Q96R67 309 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUSC2O75896 110 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APELAP0DMC3 54 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD36P16671 472 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNXAQ16473 311 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IDO2Q6ZQW0 420 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COA4Q9NYJ1 87 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSGN1A6NI15 193 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSX5O60225 188 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCGR3BO75015 233 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC22A5O76082 557 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DQB1P01920 261 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRSS8Q16651 343 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5H6Q8NGV6 325 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASCL2Q99929 193 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELOVL1Q9BW60 279 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANXA10Q9UJ72 324 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAH9Q9NYC9 4486 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV18A0A075B6X5 111 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPNP16150 400 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD9Q7L273 389 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ETV7Q9Y603 341 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPPED1O15442 326 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTL6BO94805 426 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZP3P21754 424 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAND1P57086 179 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD21Q4G0X4 260 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2B11Q5JQS5 317 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U3KQK5 164 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1-13P0DP09 117 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AADACP22760 399 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARPC4P59998 168 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFA5Q01523 94 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNCP24821 2201 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRI3O95415 125 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms