RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 MFFQ9GZY8 342 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 GAB2Q9UQC2 676 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 MSGN1A6NI15 193 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 A8MWP6 167 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 OR9G9P0C7N8 305 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 UBBP0CG47 229 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 T-ENOLP0DO92 83 aa6.51□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 SSX1Q16384 188 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 OR4A47Q6IF82 309 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.51□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 MARC2Q969Z3 335 aa6.51□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 POMPQ9Y244 141 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 A0A0J9YWU9 116 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 C2orf70A6NJV1 201 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 SPRY2O43597 315 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 DIRAS3O95661 229 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 NAPSAO96009 420 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 CRYGBP07316 175 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 RRASP10301 218 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 FOLR2P14207 255 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 ZBTB25P24278 435 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 CBX3Q13185 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 PMS2P11Q13670 270 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 NECAP1Q8NC96 275 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 OR5T1Q8NG75 326 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 RNF141Q8WVD5 230 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 SMIM19Q96E16 107 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 COA4Q9NYJ1 87 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 GYG2O15488 501 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 SOX2P48431 317 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 CENPOQ9BU64 300 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-215ENST00000592911 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 AP4S1Q9Y587 144 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 IRGMA1A4Y4 181 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 E9PI62 339 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 H3BNX3 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 OGG1O15527 345 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 IGLV2-23P01705 113 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 TRBV12-3P01733 135 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 GABRB1P18505 474 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 GALP22466 123 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 CBLN1P23435 193 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 DCKP27707 260 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-215ENST00000592911 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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