RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IFNA10P01566 189 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 MYOD1P15172 320 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LMO1P25800 156 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 NMSQ5H8A3 153 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 S1PR3Q99500 378 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IFNL4K9M1U5 179 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IFNA5P01569 189 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ATP6V0CP27449 155 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 HAGHQ16775 308 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LCN15Q6UWW0 184 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C5orf30Q96GV9 206 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 RHOFQ9HBH0 211 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 RNF212BA8MTL3 300 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 P2RY1P47900 373 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF273Q14593 569 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 HFEQ30201 348 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZS49 121 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 R3HDM4Q96D70 268 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LRRC46Q96FV0 321 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 REG4Q9BYZ8 158 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ZFP57Q9NU63 452 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PTPN13Q12923 2485 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TAAR5O14804 337 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 OR13C7P0DN81 318 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 DEFA4P12838 97 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TUBG1P23258 451 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LRTM2Q8N967 370 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 OR4A16Q8NH70 328 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 SDSLQ96GA7 329 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 MARCH11A6NNE9 402 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFB3O43676 98 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 COL8A2P25067 703 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CHRNB4P30926 498 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2KP61086 200 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 POM121Q96HA1 1249 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 COX7A1P24310 79 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CA7P43166 264 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ID3Q02535 119 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 MSMO1Q15800 293 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 LURAP1Q96LR2 239 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IFNA4P05014 189 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ERVK-16P61578 105 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 RND3P61587 244 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 GPR157Q5UAW9 335 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 RBKSQ9H477 322 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IFT22Q9H7X7 185 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 DVL1O14640 695 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PROP1O75360 226 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ADH4P08319 380 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 GUCA2BQ16661 112 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 GAFA1Q96PS6 74 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1B0GU03 582 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C15orf65H3BRN8 121 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV3-48P01763 117 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 FAM157CP0CG43 387 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ARL16Q0P5N6 197 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF266Q14584 549 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 C14orf79Q96F83 325 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-216ENST00000524481 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.6 ms