RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-201ENST00000380701 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.14□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 KNL1Q8NG31 2342 aa6.13□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 IGHV3-7P01780 117 aa6.12□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.12□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 LINC01560Q8TB33 94 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 MARCH11A6NNE9 402 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 THY1P04216 161 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 THBDP07204 575 aa6.12□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 C7orf66A4D0T2 115 aa6.12□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 CD99P14209 185 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 PSMB2P49721 201 aa6.12□□□□□ -1.43
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CCDC171-201ENST00000380701 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 RNF5Q99942 180 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 BET1LQ9NYM9 111 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 SPTA1P02549 2419 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC171-201ENST00000380701 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.11□□□□□ -1.43
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