RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	CFHR3	Q02985	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	PHF21A	Q96BD5	680 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		H7C2Y5	167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	NDUFA3	O95167	84 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TALDO1	P37837	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	NDP	Q00604	133 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	NPB	Q8NG41	125 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		A0A087WXM4	84 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		G3V318	75 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		M0R1X1	148 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	SSX5	O60225	188 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IGF1	P05019	195 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IGLL1	P15814	213 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	CD33	P20138	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	SERPINB10	P48595	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	DUX3	Q96PT4	197 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	FCN1	O00602	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RRH	O14718	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	AIRE	O43918	545 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	IGHG4	P01861	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TFAP2A	P05549	437 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	VDAC1	P21796	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	DTYMK	P23919	212 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	MC5R	P33032	325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	FOXE3	Q13461	319 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	DEFB136	Q30KP8	78 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		Q6ZS49	121 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876		J3QRK9	145 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	DIRAS3	O95661	229 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	THBS3	P49746	956 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GNG2	P59768	71 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	PLGLA	Q15195	96 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	PSG5	Q15238	335 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPSA-208	ENST00000487876	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms