RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 GTF3C1Q12789 2109 aa7.31□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ODAMA1E959 279 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PSPNO60542 156 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 WISP2O76076 250 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 HAND1O96004 215 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MBP02144 154 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SLC10A1Q14973 349 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PFDN5Q99471 154 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR2D2Q9H210 308 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 S1PR2O95136 353 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CLDN14O95500 239 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 KRASP01116 189 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CD55P08174 381 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FABP4P15090 132 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 G6PCP35575 357 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR3A1P47881 315 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PSMB3P49720 205 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ERVS71-1P61550 626 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PSG7Q13046 419 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CATR1Q13166 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ADIRFQ15847 76 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 BSXQ3C1V8 233 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 VASH2Q86V25 355 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR4X1Q8NH49 305 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GALMQ96C23 342 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MANBALQ9NQG1 85 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CLN8Q9UBY8 286 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PTPRBP23467 1997 aa7.3□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OOEPA6NGQ2 149 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C17orf98A8MV24 154 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RAB29O14966 203 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 HBZP02008 142 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RD3LP0DJH9 198 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SELEP16581 610 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PLA2G5P39877 138 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C4orf17Q53FE4 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PRR7Q8TB68 274 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DTD1Q8TEA8 209 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 COQ2Q96H96 371 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SNX22Q96L94 193 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DIRC2Q96SL1 478 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PARLQ9H300 379 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 SLC25A22Q9H936 323 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MLNRO43193 412 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZG16O60844 167 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GRPP07492 148 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PAX1P15863 534 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 COX5AP20674 150 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GZMHP20718 246 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FGF7P21781 194 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 IL2RGP31785 369 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MPLP40238 635 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GNB2P62879 340 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 COL10A1Q03692 680 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TFF3Q07654 80 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 LPAL2Q16609 132 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 Q8N7P7 452 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 OR5R1Q8NH85 324 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms