RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNK	O75909	580 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2H2	O95918	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYGD	P07320	174 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RPA2	P15927	270 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	NAT1	P18440	290 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SERPINB9	P50453	376 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	HTD2	P86397	168 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	LIPE	Q05469	1076 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CASP8	Q14790	479 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A087WUU8	490 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CBY3	A6NI87	242 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SH2D1B	O14796	132 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PHOX2A	O14813	284 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	GSTA4	O15217	222 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SULT1B1	O43704	296 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PEX11A	O75192	247 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	KDM4B	O94953	1096 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	APOC1	P02654	83 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CD14	P08571	375 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2H	P62256	183 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKCD	Q05655	676 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF146	Q15072	292 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R7	Q15435	360 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	STX1A	Q16623	288 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061		Q9HAA7	133 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ENTPD6	O75354	484 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	NRAS	P01111	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	TPM1	P09493	284 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKACA	P17612	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RASSF2	P50749	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKAA2	P54646	552 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN8	P56748	225 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2B8P	P59922	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PSG5	Q15238	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF79	Q15937	498 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061		Q3ZCU0	254 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061		Q8IYB0	196 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CBR4	Q8N4T8	237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM239	Q8WW34	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	MED31	Q9Y3C7	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061		H3BNG1	76 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RBBP9	O75884	186 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SULT1C4	O75897	302 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SRM	P19623	302 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMB6	P28072	239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	CDKN2C	P42773	168 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	SCN1B	Q07699	218 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	RIPK1	Q13546	671 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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