RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 YPEL2Q96QA6 119 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 HSF4Q9ULV5 492 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 V9GY05 133 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAH2Q9P225 4427 aa5.07□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMB11A5LHX3 300 aa5.06□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 SETD6Q8TBK2 473 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 FCGR1BQ92637 280 aa5.06□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 PECRQ9BY49 303 aa5.06□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 GPR12P47775 334 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 OR10A3P58181 314 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 C22orf42Q6IC83 251 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF329Q86UD4 541 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 SPARTQ8N0X7 666 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 COMMD1Q8N668 190 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.05□□□□□ -1.6
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CTDSPL-208ENST00000486978 HSPG2P98160 4391 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC01548A6NM66 108 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB29O14966 203 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 HSPA12AO43301 675 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 SCTP09683 121 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSPL-208ENST00000486978 CD3GP09693 182 aa5.04□□□□□ -1.6
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