RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334690.10

TRAPPC11-201, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC11, Length 4,552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-201ENST00000334690 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 TMEM54Q969K7 222 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR8B2Q96RD0 313 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 FUT9Q9Y231 359 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 J3QW42 95 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 RECKO95980 971 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR4X1Q8NH49 305 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 TREM2Q9NZC2 230 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 FGFRL1Q8N441 504 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 PERPQ96FX8 193 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 GNG7O60262 68 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 UNC119Q13432 240 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 POC1AQ8NBT0 407 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 DIRC2Q96SL1 478 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 MIOXQ9UGB7 285 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 PPIAL4DF5H284 164 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 TCL1AP56279 114 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR8G5Q8NG78 346 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 WNT2BQ93097 391 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 ZP1P60852 638 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 IL19Q9UHD0 177 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC11-201ENST00000334690 J3QR89 54 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 K7N7A8 449 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 GPR146Q96CH1 333 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 IGSF23A1L1A6 192 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 PTTG1IPP53801 180 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 A0A0B4J293 547 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 KCNMB1Q16558 191 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SOSTQ9BQB4 213 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ESPL1Q14674 2120 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ADAM11O75078 769 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ACP1P24666 158 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 FAM157AC9JC47 383 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 P2RX4Q99571 388 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 AKAP6Q13023 2319 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 COL8A1P27658 744 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 TMEM187Q14656 261 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 LRP11Q86VZ4 500 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR2V2Q96R30 315 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 FAM117AQ9C073 453 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 A0A087X0M5 115 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 A0A1B0GX30 115 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 RAMP1O60894 148 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 P01737 135 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ZNF708P17019 499 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ODAMA1E959 279 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 DANCRP0C864 163 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 CCL8P80075 99 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 NHLH1Q02575 133 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 HIST3H3Q16695 136 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 OR4C12Q96R67 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 TM2D1Q9BX74 207 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC11-201ENST00000334690 LGALS7P47929 136 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms