RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 C17orf50Q8WW18 174 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 C5orf30Q96GV9 206 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 YPEL2Q96QA6 119 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 AGMATQ9BSE5 352 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 RAB9BQ9NP90 201 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 RDH8Q9NYR8 311 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CUBNO60494 3623 aa10.23□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 PMP2P02689 132 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF735P0CB33 412 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR5H8P0DN80 308 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ZBTB25P24278 435 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 SAA4P35542 130 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 GNG10P50151 68 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 PPP5CP53041 499 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ARPC4P59998 168 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 IFITM3Q01628 133 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 DYRK1AQ13627 763 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 HLA-DRB5Q30154 266 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00311Q8N616 119 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR9G1Q8NH87 305 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 MRGPRFQ96AM1 343 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC32Q9BV29 185 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 EHFQ9NZC4 300 aa10.22□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 LY6LH3BQJ8 138 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 J3QR06 171 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ITGB1BP1O14713 200 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 NPFFO15130 113 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ST8SIA5O15466 376 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CSF1P09603 554 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 CTXN2P0C2S0 81 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 AADACP22760 399 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF137PP52743 207 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 TAS2R19P59542 299 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF846Q147U1 533 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ACTBL2Q562R1 376 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 SLC6A7Q99884 636 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 MMP28Q9H239 520 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF69Q9UC07 566 aa10.21□□□□□ -0.77
DNMT1-208ENST00000586667 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.21□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1W2PRD5 423 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1W2PRF3 423 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1W2PRM7 423 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 INAFM1C9JVW0 142 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV2-14P01704 120 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 FCGR2CP31995 323 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 BTCP35070 178 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 CEACAM6P40199 344 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 MIDNQ504T8 468 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 GINS4Q9BRT9 223 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.2□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 A0A0U1RQK1 487 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 PLA2G10O15496 165 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 HSPA12AO43301 675 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 PROP1O75360 226 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 UPK1BO75841 260 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 RGS11O94810 467 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 RAB3DO95716 219 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 PPYP01298 95 aa10.19□□□□□ -0.78
DNMT1-208ENST00000586667 ARG1P05089 322 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.8 ms