RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 M6PRP20645 277 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ID3Q02535 119 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ABHD14BQ96IU4 210 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LURAP1Q96LR2 239 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RAXQ9Y2V3 346 aa13.99□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 WRBO00258 174 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ABCD4O14678 606 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ASCL1P50553 236 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 AKR1C2P52895 323 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RBPJQ06330 500 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF585BQ52M93 769 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 FAM201AQ5SY85 155 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 STPG2Q8N412 459 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 JKAMPQ9P055 326 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GU03 582 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IGSF23A1L1A6 192 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RNF212BA8MTL3 300 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 MED6O75586 246 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LHBP01229 141 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IGHV1-46P01743 117 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PTAFRP25105 342 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 NUP37Q8NFH4 326 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 NUP50Q9UKX7 468 aa13.98□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SPINT2O43291 252 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 CHST1O43916 411 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 OMGP23515 440 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 CD80P33681 288 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LTC4SQ16873 150 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SNX22Q96L94 193 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ODAMA1E959 279 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 DPRXA6NFQ7 191 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 THBDP07204 575 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 GATA4P43694 442 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PAX5Q02548 391 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZRM9 215 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 GCM1Q9NP62 436 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 CACNG5Q9UF02 275 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IL19Q9UHD0 177 aa13.97□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 MGST3O14880 152 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PITX3O75364 302 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMEM50AO95807 157 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-5P01602 117 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SULT1A2P50226 295 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 BSPH1Q075Z2 132 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 MST1LQ2TV78 715 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PXDC1Q5TGL8 231 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 HRH4Q9H3N8 390 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RAB19A4D1S5 217 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 C15orf65H3BRN8 121 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A6P12236 298 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TNFSF4P23510 183 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LPAR6P43657 344 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 CLINT1Q14677 625 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMEM252Q8N6L7 170 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RND1Q92730 232 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 C5orf30Q96GV9 206 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SMIM8Q96KF7 97 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 ARV1Q9H2C2 271 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RNF7Q9UBF6 113 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.96□□□□□ -0.17
TOM1-216ENST00000492723 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 EDDM3BP56851 147 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 K7N7A8 449 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 UCNP55089 124 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 AKR1C1Q04828 323 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 GINS3Q9BRX5 216 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 MMP26Q9NRE1 261 aa13.95□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 B8ZZF3 427 aa13.94□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 SIGLEC5O15389 551 aa13.94□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 RAMP3O60896 148 aa13.94□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 CST7O76096 145 aa13.94□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 MMP9P14780 707 aa13.94□□□□□ -0.18
TOM1-216ENST00000492723 GZMHP20718 246 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms