RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 A6NJ64 397 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A7PA6NKC0 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A12PA8MX19 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 TOR1AO14656 332 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 DEGS1O15121 323 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 PF4P02776 101 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 CSN2P05814 226 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A15PP0C7V4 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A13PP0C7W8 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A14PP0C7W9 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A24PP0C7X0 464 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 TMEM50BP56557 158 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 LTC4SQ16873 150 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 KIRREL1Q96J84 757 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 TSC22D3Q99576 134 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 DIABLOQ9NR28 239 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-212ENST00000485532 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 A0A087X0M5 115 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GX30 115 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FUOMA2VDF0 154 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 XRCC3O43542 346 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PDCD6O75340 191 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CGB3P0DN86 165 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CGB7P0DN87 165 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CHATP28329 748 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TALDO1P37837 337 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MNDAP41218 407 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 GLP1RP43220 463 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PRRX1P54821 245 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R20P59543 309 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MPV17LQ2QL34 196 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RAB12Q6IQ22 244 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 LINC00596Q86U02 117 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF329Q86UD4 541 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CHST4Q8NCG5 386 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 KIF25Q9UIL4 384 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FABP12A6NFH5 140 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 H3BUI4 141 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MFNGO00587 321 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SCGNO76038 276 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DQB1P01920 261 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PTHLHP12272 177 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM3P40198 252 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 GNG10P50151 68 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ARHGDIBP52566 201 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF79Q15937 498 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TMEM69Q5SWH9 247 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ETV3LQ6ZN32 361 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OR56B4Q8NH76 319 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RFESDQ8TAC1 157 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RAB3CQ96E17 227 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ABHD1Q96SE0 405 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PECRQ9BY49 303 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IFT22Q9H7X7 185 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CALYQ9NYX4 217 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPE3 182 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPI3 338 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TMEM235A6NFC5 223 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 J3QR06 171 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TPPPO94811 219 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FUT3P21217 361 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF45Q02386 682 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IL18Q14116 193 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms