RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 Q3ZCU0 254 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 GHITMQ9H3K2 345 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RDH8Q9NYR8 311 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 GNG12Q9UBI6 72 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DUX4Q9UBX2 424 aa14.89□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PFDN1O60925 122 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 B3GALNT1O75752 331 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RBP4P02753 201 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SSTR5P35346 364 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR51J1Q9H342 316 aa14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0A6YYJ9 748 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 HMX3A6NHT5 357 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 GPR31O00270 319 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RAB7AP51149 207 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DHODHQ02127 395 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 CBX3Q13185 183 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 CADM3Q8N126 398 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF525Q8N782 197 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 MED28Q9H204 178 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SSNA1O43805 119 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 AKR1C4P17516 323 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RND3P61587 244 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF626Q68DY1 528 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 KCTD9Q7L273 389 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 LYG2Q86SG7 212 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RFESDQ8TAC1 157 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 HIVEP2P31629 2446 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 LIPFP07098 398 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PIGPP57054 158 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 MORN2Q502X0 79 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 COQ8AQ8NI60 647 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PHB2Q99623 299 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 BEX2Q9BXY8 128 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 BEX1Q9HBH7 125 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0B4J293 547 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0B4J2A0 478 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RNF212BA8MTL3 300 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 IGHV2-5P01817 119 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SLC25A16P16260 332 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 VAMP1P23763 118 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 GNRHRP30968 328 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 BAMBIQ13145 260 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 DHRS2Q13268 280 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 BVESQ8NE79 360 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 JMJD1CQ15652 2540 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C9orf170A2RU37 121 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 FOXH1O75593 365 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SFT2D2O95562 160 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 OR8U9P0C7N5 309 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 LOXL3P58215 753 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 SRPXP78539 464 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 TCF23Q7RTU1 214 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms