RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362		Q9N2K0	584 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	VGLL3	A8MV65	326 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IL3RA	P26951	378 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	GNG10	P50151	68 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SSX2	Q16385	188 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	HACD4	Q5VWC8	232 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	LINC00311	Q8N616	119 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	UBALD1	Q8TB05	177 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	AJUBA	Q96IF1	538 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	CUBN	O60494	3623 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IGHV4-59	P01825	116 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	FCGR3A	P08637	254 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	DTYMK	P23919	212 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	GNG2	P59768	71 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	MADCAM1	Q13477	382 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	C17orf50	Q8WW18	174 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	LEAP2	Q969E1	77 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	CYYR1	Q96J86	154 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	RNF212B	A8MTL3	300 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TRDC	B7Z8K6	153 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	LPL	P06858	475 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	MNDA	P41218	407 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	RPE	Q96AT9	228 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	DUX5	Q96PT3	197 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SSX3	Q99909	188 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	YPEL1	O60688	119 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	DIRAS3	O95661	229 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	BRS3	P32247	399 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	DYNLT3	P51808	116 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	C16orf87	Q6PH81	154 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TOMM40L	Q969M1	308 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ISOC1	Q96CN7	298 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	YPEL2	Q96QA6	119 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM235	A6NFC5	223 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362		H3BUX3	64 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	HSPA12A	O43301	675 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	XRCC3	O43542	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	IGHV3-7	P01780	117 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	APOA1	P02647	267 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB25	P24278	435 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	RAB7A	P51149	207 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	ACTG1	P63261	375 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SPCS2	Q15005	226 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362		Q6ZS49	121 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	RAB18	Q9NP72	206 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PUF60-222	ENST00000533362	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC160	A6NGH7	325 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	FABP7	O15540	132 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	CRYBA1	P05813	215 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	MORN2	Q502X0	79 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362		Q6ZPA2	131 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	CHIA	Q9BZP6	476 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362		H3BMQ9	156 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	LY6L	H3BQJ8	138 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	TXNL1	O43396	289 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	PLA1A	Q53H76	456 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	UTF1	Q5T230	341 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PUF60-222	ENST00000533362	HSD17B6	O14756	317 aa		18.12	■□□□□ 0.49

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