RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMN1Q8IY45 258 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IP6K3Q96PC2 410 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NYAP2Q9P242 653 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F5H5P2 479 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 K7ERS5 55 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRASO14807 208 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4D2P58180 307 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-DRB3P79483 266 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLO1Q04760 184 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSPAN31Q12999 210 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMED2Q15363 201 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPK14Q16539 360 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q8N9L7 120 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR51H1Q8NH63 302 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2V2Q96R30 315 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MED18Q9BUE0 208 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF492Q9P255 531 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPATQ14207 1427 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C7orf66A4D0T2 115 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR5H14A6NHG9 310 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4orf51C9J302 202 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGRNO00468 2067 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRGV3P03979 118 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALOX5APP20292 161 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGFBR2P37173 567 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPCS3P61009 180 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HERVK_113P63121 156 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FABP5Q01469 135 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPA17Q15506 151 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST3H3Q16695 136 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q6P435 159 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 S100A7AQ86SG5 101 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NIT1Q86X76 327 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF567Q8N184 647 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q8WTZ3 238 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MED28Q9H204 178 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INIPQ9NRY2 104 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL37Q9NZH6 218 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPN4Q9UHM6 478 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLDN24A6NM45 220 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGLL5B9A064 214 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 D6RAR5 112 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERPINA1P01009 418 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTHLHP12272 177 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDTP30046 118 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPV17P39210 176 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTBP2P56545 445 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VBP1P61758 197 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FUT5Q11128 374 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IHHQ14623 411 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMDQ15546 238 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.05□□□□□ -1.92
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