RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 CEBPEQ15744 281 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 CEACAM21Q3KPI0 293 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ZNF383Q8NA42 475 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ZNF488Q96MN9 340 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 RABAC1Q9UI14 185 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 USP54Q70EL1 1684 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 HPRT1P00492 218 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 FSTP19883 344 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ZNF345Q14585 488 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ECSCRQ19T08 205 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 FAM214BQ7L5A3 538 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 KLK13Q9UKR3 277 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.1■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 C7orf66A4D0T2 115 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 HTN1P15515 57 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ATP6V0CP27449 155 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 SCGB1D4Q6XE38 83 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 DIRC2Q96SL1 478 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 K7N7A8 449 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 H3BQ15 152 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 CCL8P80075 99 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 Q6ZN92 141 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 APELAP0DMC3 54 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 REG1BP48304 166 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 TMEM251Q8N6I4 163 aa16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 CORTO00230 105 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 TSPAN2O60636 221 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 SNX22Q96L94 193 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.08■□□□□ 0.17
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PPE3 182 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ISLRO14498 428 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 CIDEAO60543 219 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 UCP2P55851 309 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ZNF273Q14593 569 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 DPPA3Q6W0C5 159 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 FOXL2P58012 376 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ERVFRD-1P60508 538 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 DYNLRB2Q8TF09 96 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 FGF12P61328 243 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.08■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 PITX3O75364 302 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 MESP2Q0VG99 397 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 FGF11Q92914 225 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ZNF714Q96N38 554 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ERGP11308 486 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 KRTCAP3Q53RY4 240 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 FUT9Q9Y231 359 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 LIMS1P48059 325 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.07■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 CD1BP29016 333 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 WNT5AP41221 380 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 PSMB2P49721 201 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 STARD4Q96DR4 205 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 AREGP15514 252 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SERF2P84101 59 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SLC35E4Q6ICL7 350 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SNURFLB1AK76 121 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 RHBDL1O75783 438 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 MGPP08493 103 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 CXCL2P19875 107 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 ID1P41134 155 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 NPVFQ9HCQ7 196 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 HYPMO75409 117 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 IL11P20809 199 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 HOXA6P31267 233 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 SPRED2Q7Z698 418 aa16.06■□□□□ 0.16
USP25-204ENST00000400183 PRF1P14222 555 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms