RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CLEC6AQ6EIG7 209 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SPNS3Q6ZMD2 512 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CALHM3Q86XJ0 350 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LYPD6Q86Y78 171 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DOLPP1Q86YN1 238 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CPNE9Q8IYJ1 553 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HS3ST5Q8IZT8 346 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LYPD1Q8N2G4 141 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 YIPF7Q8N8F6 280 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 Q8NAQ8 132 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ACBD4Q8NC06 268 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR4P4Q8NGL7 312 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TAMM41Q96BW9 452 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM208Q9BTX3 173 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR54Q9H977 334 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C15orf41Q9Y2V0 281 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CRB1P82279 1406 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RIMS2Q9UQ26 1411 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SHANK1Q9Y566 2161 aa1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 F5H5K5 113 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 M0QYV0 167 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PHYHO14832 338 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP8B1O43520 1251 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CYTH3O43739 400 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 YEATS4O95619 227 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LTAP01374 205 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ORM1P02763 201 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GUSBP08236 651 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TPM4P67936 248 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 COTL1Q14019 142 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C4orf26Q17RF5 130 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MESTQ5EB52 335 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CENPWQ5EE01 88 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C10orf91Q5T1B1 145 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFAND6Q6FIF0 208 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 EBLN2Q6P2I7 272 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 Q6ZQT7 251 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CD302Q8IX05 232 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM9CQ8IZT9 166 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM75Q8N9X5 138 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DTD1Q8TEA8 209 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CMBLQ96DG6 245 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF426Q9BUY5 554 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ARL6Q9H0F7 186 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCG5Q9H222 651 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF286AQ9HBT8 521 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DYSFO75923 2080 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NUP205Q92621 2012 aa1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SEC16AO15027 2179 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DAPL1A0PJW8 107 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM213A2RRL7 107 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 METTL15A6NJ78 407 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 F5H5T6 163 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SYNGR2O43760 224 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX14O95416 240 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGHV3-53P01767 116 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TPM3P06753 285 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR13C7P0DN81 318 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR12D1P0DN82 309 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PSKH1P11801 424 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CXCL3P19876 107 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 F8A1P23610 371 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CDK9P50750 372 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ACTBP60709 375 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ACTG1P63261 375 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM3AP98173 230 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C1DQ13901 141 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PDGFRLQ15198 375 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TAF9Q16594 264 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 EXOC3L4Q17RC7 722 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D28Q2M2D7 210 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HLA-DRB5Q30154 266 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAL1Q4LDG9 190 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM45BPQ6NSW5 357 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NOXRED1Q6NXP6 359 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RPRMLQ8N4K4 120 aa1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LFNGQ8NES3 379 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms