RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MSMBP08118 114 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01356Q8N9X3 169 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 OR51S1Q8NGJ8 323 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 OR56B4Q8NH76 319 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 PRRT1Q99946 306 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 ZANQ9Y493 2812 aa24.4■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 MEIKINA0A087WXM9 373 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 ODAMA1E959 279 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 AMY2AP04746 511 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 BCAP31P51572 246 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 FAM185AQ8N0U4 392 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 OR5AP2Q8NGF4 316 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 MMP26Q9NRE1 261 aa24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
ECHS1-201ENST00000368547 GZMKP49863 264 aa24.39■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 PAX2Q02962 417 aa24.39■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 GAPTQ8N292 157 aa24.39■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 ARRDC1Q8N5I2 433 aa24.39■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf46Q8TAG6 207 aa24.39■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM200BQ69YZ2 307 aa24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 LY6G5BQ8NDX9 201 aa24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 OR5H2Q8NGV7 314 aa24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 C20orf85Q9H1P6 137 aa24.38■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa24.38■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV39A0A0B4J263 110 aa24.37■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa24.37■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 PPIAL4GP0DN37 164 aa24.37■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TCF23Q7RTU1 214 aa24.37■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 LPAR3Q9UBY5 353 aa24.37■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF273Q14593 569 aa24.36■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 CADM3Q8N126 398 aa24.36■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa24.36■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF286AQ9HBT8 521 aa24.36■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa24.36■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 DHFRP00374 187 aa24.35■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 PMP2P02689 132 aa24.35■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 OR3A3P47888 321 aa24.35■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 C18orf12Q96KH6 178 aa24.35■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.491e-7■■■■■ 28.2
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ECHS1-201ENST00000368547 LIPFP07098 398 aa24.35■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 GLP1RP43220 463 aa24.35■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 TRAV6A0A075B6T7 132 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 CDK10Q15131 360 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TATDN3Q17R31 274 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF880Q6PDB4 577 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZPA2 131 aa24.34■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF565Q8N9K5 539 aa24.34■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 MAFIPQ8WZ33 124 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM186Q96B77 213 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 GINS4Q9BRT9 223 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 Q9N2K0 584 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 HIF1ANQ9NWT6 349 aa24.34■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV20A0A0B4J274 112 aa24.33■■□□□ 1.49
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ECHS1-201ENST00000368547 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC4P59998 168 aa24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 CHAC2Q8WUX2 184 aa24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 CORO2AQ92828 525 aa24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0B4J293 547 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 PEX14O75381 377 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 BTNL3Q6UXE8 466 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 MOB1BQ7L9L4 216 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 MGAT4AQ9UM21 535 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 INSIG2Q9Y5U4 225 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF714Q96N38 554 aa24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ECHS1-201ENST00000368547 NECAP2Q9NVZ3 263 aa24.32■■□□□ 1.48
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