RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297668.10

CNTNAP3-201, Transcript of contactin associated protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTNAP3, Length 5,064 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3-201ENST00000297668 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 GHITMQ9H3K2 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 UFC1Q9Y3C8 167 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 IGSF23A1L1A6 192 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 HELTA6NFD8 242 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 SYNGR1O43759 233 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 HLA-DQB1P01920 261 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 C1RLQ9NZP8 487 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 TCF21O43680 179 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 LIMS1P48059 325 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR1L1Q8NH94 360 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 IL17BQ9UHF5 180 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 TMEM210A6NLX4 147 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR4X1Q8NH49 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3-201ENST00000297668 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TMEM65Q6PI78 240 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 NGFRP08138 427 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 FSTP19883 344 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 NAAAQ02083 359 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TFF2Q03403 129 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DCAF10Q5QP82 559 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TEPPQ6URK8 271 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR8B2Q96RD0 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 NPAS1Q99742 590 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 COA4Q9NYJ1 87 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 A0A0J9YW62 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 IGHV4-34P06331 123 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 AESQ08117 197 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 KHDC3LQ587J8 217 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 FCGR3AP08637 254 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 A0A0U1RQV5 110 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 UPK3AO75631 287 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RIGQ13278 110 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 FDX2Q6P4F2 183 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 CXorf1O96002 111 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 MDP1Q86V88 176 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 PERPQ96FX8 193 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RND1Q92730 232 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 MESP2Q0VG99 397 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZNF383Q8NA42 475 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 Q8WTZ3 238 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.63□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 MELTFP08582 738 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 CXCL2P19875 107 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 SNURFLB1AK76 121 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 J3QR06 171 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 PPOXP50336 477 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ZNF488Q96MN9 340 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.62□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.61□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 F2RL2O00254 374 aa14.61□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 SMPD2O60906 423 aa14.61□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 PITX3O75364 302 aa14.61□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 DEDDO75618 318 aa14.61□□□□□ -0.07
CNTNAP3-201ENST00000297668 ERGP11308 486 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms