RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 MADCAM1Q13477 382 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PYDC2Q56P42 97 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC190Q86UF4 302 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 YIPF5Q969M3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB39BQ96DA2 213 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 SERPINE3A8MV23 424 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPB6O14558 160 aa9.49□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF561Q8N587 486 aa9.49□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 MED30Q96HR3 178 aa9.49□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0A6YYD4 124 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2QL1A1L167 161 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 FUOMA2VDF0 154 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RP2O75695 350 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 JTBO76095 146 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CHATP28329 748 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNJ3P48549 501 aa9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 SNX22Q96L94 193 aa9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 IFT46Q9NQC8 304 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ETAA1Q9NY74 926 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM235A6NFC5 223 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 CTDSPLO15194 276 aa9.47□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 LMO1P25800 156 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 CD40LGP29965 261 aa9.47□□□□□ -0.89
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CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM50BP56557 158 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMYND11Q15326 602 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 GRK1Q15835 563 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 HACD4Q5VWC8 232 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6P435 159 aa9.47□□□□□ -0.89
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