RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 KRT36O76013 467 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TFAP2AP05549 437 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RBP2P50120 134 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF137PP52743 207 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ATP1B3P54709 279 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SYNJ2BPP57105 145 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CPOQ8IVL8 374 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MS4A10Q96PG2 267 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RAB21Q9UL25 225 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CCDC182A6NF36 153 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MSGN1A6NI15 193 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 OR11H12B2RN74 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 C15orf65H3BRN8 121 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 DEGS1O15121 323 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CCNB2O95067 398 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZP3P21754 424 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ACTBP60709 375 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 PAX5Q02548 391 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 LSAMPQ13449 338 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ODF4Q2M2E3 257 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 LIN54Q6MZP7 749 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RFT1Q96AA3 541 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CYB5AP00167 134 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF134P52741 427 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MTCP1P56278 107 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 LAX1Q8IWV1 398 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RDH10Q8IZV5 341 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MRGBPQ9NV56 204 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 NBR2O15453 112 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SYT7O43581 403 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 NDUFA3O95167 84 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ATF1P18846 271 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MAGEA2P43356 314 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TPPP2P59282 170 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CX3CL1P78423 397 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 DYRK1AQ13627 763 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 APOFQ13790 326 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 HDXQ7Z353 690 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF575Q86XF7 245 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 NPBQ8NG41 125 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 UBALD1Q8TB05 177 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 H0YJX3 145 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 FCN1O00602 326 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 RTL8CO15255 209 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TXNL1O43396 289 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 TRBV12-3P01733 135 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 COX4I1P13073 169 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 IL3RAP26951 378 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ALDH3A2P51648 485 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CXCR4P61073 352 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF45Q02386 682 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 GINS1Q14691 196 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 MICAQ29983 383 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-208ENST00000547298 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms