RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51F1A6NGY5 319 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM9A6NGZ8 99 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 BHLHE40O14503 412 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYL12BO14950 172 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSTPIP1O43586 416 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX7A2P2O60397 106 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 LY6G6CO95867 125 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL3P10147 92 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRG2P18507 467 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNOP22674 350 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRHBPP24387 322 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR2AP28223 471 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFNP31947 248 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN6P56747 220 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTBL2Q562R1 376 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDZK1Q5T2W1 519 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF550Q7Z398 422 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNT10Q86SR1 603 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 YPEL4Q96NS1 127 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSGA10Q9BZW7 698 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGLQ9Y2B2 252 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCN3AQ9NY46 2000 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPE3 182 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM170AA1A519 330 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 J3QLI3 93 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM50AO95807 157 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 UCHL1P09936 223 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB4AP20338 218 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA8P35219 290 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNGR2P38484 337 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT2A3Q6UWM9 527 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PROKR2Q8NFJ6 384 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SENP8Q96LD8 212 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSMCE2Q96MF7 247 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIEN1Q9BRT3 115 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSIG2Q9Y5U4 225 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCAPD2Q15021 1401 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTTP42858 3142 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF24Q5T7B8 1368 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME4O00746 187 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDC80O14777 642 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANGPT2O15123 496 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN11O75508 207 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAL4O96015 105 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD7P09564 240 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCK1P16333 377 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRS3P32247 399 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CASP2P42575 452 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB4BP61018 213 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYZL1Q6UWQ5 148 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSX7Q7RTT5 188 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52K1Q8NGK4 314 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10AC1Q8NH08 325 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf35Q96D05 121 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FICDQ9BVA6 458 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MND1Q9BWT6 205 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 REEP1Q9H902 201 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEX16Q9Y5Y5 336 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FREM3P0C091 2139 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL9O00512 1426 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD65E5RJM6 399 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCR2P41597 374 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX6A2Q02221 97 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMVKQ15126 192 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TPGS1Q6ZTW0 290 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA13Q8N1Q1 262 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8B3Q8NGG8 313 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF675Q8TD23 568 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPACA1Q9HBV2 294 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLE4Q9NR33 117 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A14Q9Y267 594 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 F5P12259 2224 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL12A1Q99715 3063 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 GREB1Q4ZG55 1949 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GWJ7 208 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ODAMA1E959 279 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R3G1 203 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFS5O43920 106 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHRS3O75911 302 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CECR9P0C854 216 aa-3.21□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 544.5 ms