RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 EBPLQ9BY08 206 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TSGA10Q9BZW7 698 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DUSP21Q9H596 190 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CD300AQ9UGN4 299 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NAGKQ9UJ70 344 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FADS3Q9Y5Q0 445 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NID2Q14112 1375 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP170Q5SW79 1584 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SVILO95425 2214 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO5BQ9ULV0 1848 aa1.15□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR5H14A6NHG9 310 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C9J4A7 227 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C15orf65H3BRN8 121 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA8RI6L899 631 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TCF21O43680 179 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP6V1G2O95670 118 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 EPPINO95925 133 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGKV1D-12P01611 117 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 INAFM2P0DMQ5 153 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PTHLHP12272 177 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MLNP12872 115 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PSMB6P28072 239 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CRABP2P29373 138 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GRPRP30550 384 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PYCR1P32322 319 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ACTR1BP42025 376 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HSPA13P48723 471 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SULT1A2P50226 295 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 UBE2G2P60604 165 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SKP1P63208 163 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 APOFQ13790 326 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM162BQ5T6X4 162 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM215Q68D42 235 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SSX7Q7RTT5 188 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TCF23Q7RTU1 214 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PAGE2Q7Z2X7 111 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 COMTD1Q86VU5 262 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 BLIDQ8IZY5 108 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MUC15Q8N387 334 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC25A45Q8N413 288 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR8A1Q8NGG7 326 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR5D18Q8NGL1 313 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RORBQ92753 470 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF251Q9BRH9 671 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RHOFQ9HBH0 211 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ASF1BQ9NVP2 202 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 DMAC2Q9NW81 257 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C1orf109Q9NX04 203 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 EURLQ9NYK6 297 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 OR51B4Q9Y5P0 310 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 R4GN34 69 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 U3KQK5 164 aa1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 ARGFXA6NJG6 315 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 LEUTXA8MZ59 168 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GGTLC3B5MD39 225 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BMM0 161 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 COCHO43405 550 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 POP7O75817 140 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PDYNP01213 254 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GYPCP04921 128 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 P0C880 135 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PET100P0DJ07 73 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 GABRA3P34903 492 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RCVRNP35243 200 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 COILP38432 576 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CRATP43155 626 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXA1P55317 472 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MP68P56378 58 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 CLDN12P56749 244 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TSPAN31Q12999 210 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 SKP2Q13309 424 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM249Q2WGJ8 235 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 HES3Q5TGS1 186 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 PDPK2PQ6A1A2 396 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NIPAL1Q6NVV3 410 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 NT5DC3Q86UY8 548 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 MSRB3Q8IXL7 192 aa1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1-232ENST00000636483 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms