RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559840.1

CYCSP38-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 38, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP38, Length 322 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP38-201ENST00000559840 ATF1P18846 271 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 PRKACBP22694 351 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR3A4PP47883 348 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ARHGDIBP52566 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 MTCP1P56278 107 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CD69Q07108 199 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 BNIP1Q12981 228 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.85□□□□□ -1.63
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CYCSP38-201ENST00000559840 IRF3Q14653 427 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ATP6AP1Q15904 470 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 TP53I3Q53FA7 332 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR52W1Q6IF63 320 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 UTS2BQ765I0 119 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF329Q86UD4 541 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR51A4Q8NGJ6 313 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR56B4Q8NH76 319 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 THRSPQ92748 146 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 DPF1Q92782 380 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CORO2AQ92828 525 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 STMN2Q93045 179 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 SPSB1Q96BD6 273 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 KIRREL1Q96J84 757 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OPALINQ96PE5 141 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 SPACA5Q96QH8 159 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 MBOAT4Q96T53 435 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CIB1Q99828 191 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF649Q9BS31 505 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ING3Q9NXR8 418 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.85□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OOSP1A8MZH6 123 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 G3V2T6 193 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 H0YHG0 523 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 HSPB6O14558 160 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 TOR1AO14656 332 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 GYG2O15488 501 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 IGHV3-7P01780 117 aa4.84□□□□□ -1.63
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CYCSP38-201ENST00000559840 THBS3P49746 956 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ZP1P60852 638 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CTAG1AP78358 180 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CDK5R1Q15078 307 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 Q6P435 159 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CHST4Q8NCG5 386 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 OR4D6Q8NGJ1 314 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 LEAP2Q969E1 77 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 TOMM40LQ969M1 308 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 RAB24Q969Q5 203 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 RPEQ96AT9 228 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 EME1Q96AY2 570 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 FGGYQ96C11 551 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 C16orf92Q96LL3 132 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CMTM3Q96MX0 182 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 P2RX4Q99571 388 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 CALYQ9NYX4 217 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 GLS2Q9UI32 602 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP38-201ENST00000559840 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 FUOMA2VDF0 154 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP38-201ENST00000559840 SERPINE3A8MV23 424 aa4.83□□□□□ -1.64
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