RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2AG1Q9H205 316 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 WDR76Q9H967 626 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TREM1Q9NP99 234 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KLK13Q9UKR3 277 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KCNK6Q9Y257 313 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SCN2AQ99250 2005 aa4.1□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRV1 198 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF724A8MTY0 619 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SOCS3O14543 225 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC31A2O15432 143 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CYB5AP00167 134 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 IFNA17P01571 189 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 IGHMP01871 453 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CXCL10P02778 98 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CISD3P0C7P0 127 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PET100P0DJ07 73 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SFTPCP11686 197 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CPMP14384 443 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SELEP16581 610 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FCARP24071 287 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CXCR1P25024 350 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 CTNNB1P35222 781 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 PPT1P50897 306 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PKIAP61925 76 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LY6DQ14210 128 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC17A1Q14916 467 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SGCBQ16585 318 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 OPN5Q6U736 354 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 Q7L0L9 218 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HMGN2P46Q86SG4 172 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LFNGQ8NES3 379 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2L3Q8NG85 312 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 OR4K13Q8NH42 304 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR51A7Q8NH64 312 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OTOSQ8NHW6 89 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 M1APQ8TC57 530 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMEM230Q96A57 120 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C14orf79Q96F83 325 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C2orf50Q96LR7 162 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GINS3Q9BRX5 216 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NUDT9Q9BW91 350 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.09□□□□□ -1.75
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TRDN-204ENST00000542443 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB22AQ9UL26 194 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.09□□□□□ -1.76
TRDN-204ENST00000542443 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.09□□□□□ -1.76
TRDN-204ENST00000542443 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.08□□□□□ -1.76
TRDN-204ENST00000542443 TMEM72A0PK05 275 aa4.08□□□□□ -1.76
TRDN-204ENST00000542443 IGLON5A6NGN9 336 aa4.08□□□□□ -1.76
TRDN-204ENST00000542443 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
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