RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	SNX22	Q96L94	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061		A8MWP6	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	MFNG	O00587	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	NBR2	O15453	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	XRCC2	O43543	280 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	PROP1	O75360	226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	FCER2	P06734	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CRABP2	P29373	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	AQP2	P41181	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	OR3A3	P47888	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP1B3	P54709	279 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RX3	P56373	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	PRDX4	Q13162	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	SNCB	Q16143	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	AQP3	Q92482	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0B4J2E0	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GX12	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061		H7C1C5	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	SIVA1	O15304	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	PIAS1	O75925	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYGA	P11844	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	GABRR1	P24046	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	LCN6	P62502	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	MT1H	P80294	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM3A	P98173	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	LSAMP	Q13449	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	STH	Q8IWL8	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PS18	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061		F5H768	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	TUSC2	O75896	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2C1	O95371	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	SPP1	P10451	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	C4BPB	P20851	252 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	FMO3	P31513	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	PYCR1	P32322	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-222	ENST00000626061	GNG3	P63215	75 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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