RNA–Protein interactions for RNA: YKL093W

MBR1, Transcript of Protein involved in mitochondrial functions and stress response, yeast

Gene MBR1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MBR1	YKL093W	SPO75	Q07798	868 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	CBP1	P07252	654 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	NGG1	P32494	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	PAH1	P32567	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	GYP8	P43570	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	NIT3	P49954	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	TAD1	P53065	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	IRC13	Q08630	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SSP2	Q08646	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	TGL5	Q12043	749 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	KCC4	P25389	1037 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	YCL002C	P25565	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SAK1	P38990	1142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	BAP3	P41815	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SGO1	Q08490	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	ARE1	P25628	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	TDP1	P38319	544 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	PCL5	P38794	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	ASM4	Q05166	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	CRR1	Q05790	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	CIT1	P00890	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	BCD1	P38772	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	FMP52	P40008	231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	HXT16	P47185	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	DAM1	P53267	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	ATP25	Q03153	612 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	NSE3	Q05541	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	FLO11	P08640	1367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	SIR3	P06701	978 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	UBC11	P52492	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	HUL5	P53119	910 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	COQ11	Q05892	277 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	REH1	Q06709	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MBR1	YKL093W	PRC1	P00729	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	FLO10	P36170	1169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ECM1	P39715	212 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	PSF2	P40359	213 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	SNM1	P40993	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	GSM1	P42950	618 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TEL2	P53038	688 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	IMO32	P53219	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TAF3	Q12297	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	KRE2	P27809	442 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	BET3	P36149	193 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YBR259W	P38338	688 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TIM54	P47045	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YJL049W	P47048	450 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ZIP2	P53061	704 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	RSC3	Q06639	885 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	CIT2	P08679	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
MBR1	YKL093W	CDC43	P18898	376 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	HIR1	P32479	840 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ALG2	P43636	503 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	RNH70	P53331	553 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	SSL2	Q00578	843 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	KIN3	P22209	435 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	PPZ2	P33329	710 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YIL166C	P40445	542 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	UBX2	Q04228	584 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ARO10	Q06408	635 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	MET7	Q08645	548 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	ADY2	P25613	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
MBR1	YKL093W	RTA1	P53047	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	YAP1802	P53309	568 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	RPN4	Q03465	531 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MBR1	YKL093W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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