RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635562.1

PSPC1-208, Transcript of paraspeckle component 1, human

TSL 3

Gene PSPC1, Length 422 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSPC1-208	ENST00000635562	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562		H3BRJ5	948 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	WISP1	O95388	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	SPINK2	P20155	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ARL4D	P49703	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TM4SF5	O14894	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	WNT11	O96014	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PCSK2	P16519	638 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	EPHA1	P21709	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CEP120	Q8N960	986 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	HMX2	A2RU54	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	MED26	O95402	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	MAPK1	P28482	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	GJD3	Q8N144	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	NDUFB5	O43674	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ADAM11	O75078	769 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PDGFA	P04085	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	BMP3	P12645	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	DSC3	Q14574	896 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	GPR182	O15218	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	TREH	O43280	583 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	IGSF3	O75054	1194 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	CES1	P23141	567 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	CDC25B	P30305	580 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	PREP	P48147	710 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	EDEM1	Q92611	657 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSPC1-208	ENST00000635562	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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