RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601870.1

AC008878.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene AC008878.2, Length 942 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008878.2-201ENST00000601870 JAG2Q9Y219 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 CEP290O15078 2479 aa22.16■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 KCNJ4P48050 445 aa22.15■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 CCDC27Q2M243 656 aa22.15■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.15■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.14■■□□□ 1.14
AC008878.2-201ENST00000601870 F8W031 263 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 FOXO4P98177 505 aa22.14■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 SREBF2Q12772 1141 aa22.14■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 LINS1Q8NG48 757 aa22.14■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 CLRN2A0PK11 232 aa22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 DLGAP5Q15398 846 aa22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.13■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 F6X3S4 739 aa22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 FKTNO75072 461 aa22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.12■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 IL16Q14005 1332 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 VAMP4O75379 141 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 IL1R1P14778 569 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 MMP14P50281 582 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 CFAP100Q494V2 611 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 WNK4Q96J92 1243 aa22.1■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 SPDYE6P0CI01 402 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 GJA5P36382 358 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 MAP3K11Q16584 847 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 IFNL1Q8IU54 200 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.09■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 CAP1Q01518 475 aa22.08■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 BEND3Q5T5X7 828 aa22.08■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 VEZTQ9HBM0 779 aa22.08■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AC008878.2-201ENST00000601870 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.07■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.07■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 MRS2Q9HD23 443 aa22.07■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PLIN1O60240 522 aa22.06■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.06■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 TRIM17Q9Y577 477 aa22.06■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.05■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 POTEFA5A3E0 1075 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 CRHR2Q13324 411 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 RASA3Q14644 834 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PTPN18Q99952 460 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.04■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 ALDH1A1P00352 501 aa22.03■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 GRIK5Q16478 980 aa22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
AC008878.2-201ENST00000601870 GRM8O00222 908 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 MYO1BO43795 1136 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 GYG1P46976 350 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 AK9Q5TCS8 1911 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.01■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 INHBEP58166 350 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 SPDYE2Q495Y8 402 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 KAZALD1Q96I82 304 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 TEPSINQ96N21 525 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 ELP3Q9H9T3 547 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 CNNM1Q9NRU3 951 aa22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 WDR63Q8IWG1 891 aa21.98■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 SUCLG2Q96I99 432 aa21.98■■□□□ 1.11
AC008878.2-201ENST00000601870 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms